Peter Schipka wurde am 29. Dezember 1970 in Wien geboren, wo er auch Kindheit, Schul- und Studienzeit verbrachte. Im Jahr 2001 wurde er zum Diakon geweiht, im Jahr darauf empfing er die Priesterweihe. Von 2002 bis 2004 wirkte er als Kaplan in Mödling (Pfarre St. Othmar) und als Religionslehrer.

Nach der Schulzeit in Wien absolvierte Schipka von 1989 bis 1994 das Studium der Rechtswissenschaften an der Universität Wien, 1997 promovierte er zum Doktor juris. 2002 schloss er das Studium der katholischen Fachtheologie an der Universität Wien ab, das er 1995 begonnen hatte. 2004 begann Schipka das Promotionsstudium im Bereich der Moraltheologie an der Universität Regensburg, wo er von 2007 - 2010 als wissenschaftlicher Mitarbeiter tätig war.